Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SKAP2O75563 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms