Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NIPSNAP2O75323 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NIPSNAP2O75323 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms