Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TLR5O60602 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TLR5O60602 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TLR5O60602 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TLR5O60602 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TLR5O60602 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TLR5O60602 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TLR5O60602 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TLR5O60602 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TLR5O60602 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLR5O60602 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLR5O60602 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TLR5O60602 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLR5O60602 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLR5O60602 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TLR5O60602 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLR5O60602 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLR5O60602 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TLR5O60602 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TLR5O60602 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLR5O60602 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLR5O60602 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TLR5O60602 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLR5O60602 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TLR5O60602 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TLR5O60602 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TLR5O60602 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms