Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PLXNC1O60486 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms