Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

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Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
COCHO43405 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
COCHO43405 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
COCHO43405 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COCHO43405 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COCHO43405 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
COCHO43405 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COCHO43405 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COCHO43405 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COCHO43405 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COCHO43405 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COCHO43405 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COCHO43405 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COCHO43405 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COCHO43405 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COCHO43405 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
COCHO43405 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COCHO43405 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
COCHO43405 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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