Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1O43347 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MSI1O43347 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MSI1O43347 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSI1O43347 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSI1O43347 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSI1O43347 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSI1O43347 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSI1O43347 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSI1O43347 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSI1O43347 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSI1O43347 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSI1O43347 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
MSI1O43347 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSI1O43347 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSI1O43347 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSI1O43347 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MSI1O43347 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MSI1O43347 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms