Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KCNN4O15554 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms