Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC3O15379 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC3O15379 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC3O15379 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDAC3O15379 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC3O15379 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC3O15379 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC3O15379 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC3O15379 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC3O15379 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC3O15379 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC3O15379 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC3O15379 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC3O15379 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC3O15379 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC3O15379 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC3O15379 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDAC3O15379 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDAC3O15379 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDAC3O15379 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms