Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.02■□□□□ -0
UBDO15205 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBDO15205 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBDO15205 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBDO15205 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBDO15205 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBDO15205 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBDO15205 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBDO15205 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBDO15205 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBDO15205 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBDO15205 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBDO15205 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBDO15205 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBDO15205 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBDO15205 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
UBDO15205 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
UBDO15205 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
UBDO15205 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms