Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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BCKDKO14874 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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BCKDKO14874 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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BCKDKO14874 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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BCKDKO14874 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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BCKDKO14874 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
BCKDKO14874 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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