Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.05■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C4orf47A7E2U8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
C4orf47A7E2U8 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms