Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM3A6NNA2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM3A6NNA2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms