Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NPIPB13A6NJU9 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NPIPB13A6NJU9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.3 ms