Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HMX2A2RU54 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms