Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms