Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
UTP11Q9Y3A2 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms