Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRG3Q9Y2Y8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 517.9 ms