Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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KCNIP3Q9Y2W7 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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KCNIP3Q9Y2W7 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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KCNIP3Q9Y2W7 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
KCNIP3Q9Y2W7 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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KCNIP3Q9Y2W7 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
KCNIP3Q9Y2W7 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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