Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RNF7Q9UBF6 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RNF7Q9UBF6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RNF7Q9UBF6 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RNF7Q9UBF6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RNF7Q9UBF6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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