Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KLHL42Q9P2K6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KLHL42Q9P2K6 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms