Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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USP35Q9P2H5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
USP35Q9P2H5 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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