Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSD3Q9NYI0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PSD3Q9NYI0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms