Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CACNA2D2Q9NY47 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CACNA2D2Q9NY47 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms