Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CHST12Q9NRB3 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms