Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLCO1B3Q9NPD5 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLCO1B3Q9NPD5 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms