Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ERVK-5Q9HDB9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms