Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KIAA1549Q9HCM3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KIAA1549Q9HCM3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms