Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C11orf49Q9H6J7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C11orf49Q9H6J7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms