Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MGME1Q9BQP7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MGME1Q9BQP7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms