Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRIQ1Q96JM4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRIQ1Q96JM4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms