Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC97Q96F63 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms