Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ERP27Q96DN0 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms