Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C18orf8Q96DM3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms