Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG2BQ96BY7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG2BQ96BY7 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms