Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
TMIGD2Q96BF3 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms