Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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SPTSSAQ969W0 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SPTSSAQ969W0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SPTSSAQ969W0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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SPTSSAQ969W0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPTSSAQ969W0 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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