Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SCAMP4Q969E2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms