Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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RABGGTAQ92696 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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RABGGTAQ92696 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGGTAQ92696 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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