Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBXN4Q92575 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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UBXN4Q92575 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UBXN4Q92575 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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