Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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SEMA6DQ8NFY4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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SEMA6DQ8NFY4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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SEMA6DQ8NFY4 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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SEMA6DQ8NFY4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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SEMA6DQ8NFY4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SEMA6DQ8NFY4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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