Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BEST4Q8NFU0 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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BEST4Q8NFU0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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BEST4Q8NFU0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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BEST4Q8NFU0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BEST4Q8NFU0 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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