Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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ZNF548Q8NEK5 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF548Q8NEK5 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF548Q8NEK5 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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