Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71DQ8N9W8 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM71DQ8N9W8 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms