Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYT2Q8N9I0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms