Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
GCSAMQ8N6F7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms