Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
UBE2Q1Q7Z7E8 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms