Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRADAQ7RTN6 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRADAQ7RTN6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRADAQ7RTN6 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRADAQ7RTN6 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRADAQ7RTN6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRADAQ7RTN6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRADAQ7RTN6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRADAQ7RTN6 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRADAQ7RTN6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRADAQ7RTN6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRADAQ7RTN6 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
STRADAQ7RTN6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRADAQ7RTN6 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRADAQ7RTN6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRADAQ7RTN6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRADAQ7RTN6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRADAQ7RTN6 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
STRADAQ7RTN6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRADAQ7RTN6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
STRADAQ7RTN6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
STRADAQ7RTN6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms