Protein–RNA interactions for Protein: Q6YBV0

SLC36A4, Proton-coupled amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A4Q6YBV0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SLC36A4Q6YBV0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms