Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VITQ6UXI7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms