Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CCBE1Q6UXH8 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CCBE1Q6UXH8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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